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目前有機棉認證主要有全球紡織品標準（GOTS）認證、有機含量標準（OCS）認證，這兩大體系。(一般做過GOTS認證，客戶不會要求再做OCS。但是做過OCS認證可能會被要求做GOTS)
有機紡織標準，簡稱GOTS。該標準由國際天然紡織品協會（IVN）、日本有機棉協會（JOCA），美國有機貿易協會（OTA）和英國土壤協會（SA）組成的GOTS國際工作組IWG共同制定和發布。
全球有機紡織品認證標準（GOTS）的主要定義是確保紡織品有機狀態方面的要求，包括原材料的收割，對環境和社會責任的生產，以及標識、以確保消費者對產品的信息。
該標準對有機紡織品的加工、制造、包裝、標簽，進出口及分銷都作出了相關的條款。最終產品可能包括，但并不限于：纖維產品、紗線、織物、衣服和家用紡織品，本標準只關注強制性要求。
有機含量標準，簡稱OCS。該標準通過跟蹤有機原材料的種植從而監管整個有機產業鏈。Textile Exchange表示，OCS將取代現有的OE(Organic Exchange)混紡標準。此外，OCS將應用于各種有機種植原料的驗證，而不只限于有機棉。
有機物含量標準(OCS）能夠應用于所有含有5%-100%有機原料的非食品產品。此標準能夠用于證實最終產品中的有機原料含量。
它能夠用于從原料源頭追溯至最終產品且此過程都有一個可信的第三方組織進行認證。在完全獨立評估產品有機含量的過程中，標準將秉承透明性和一致性。此標準可以作為公司之間的商務工具用以幫助企業確保其購買的或支付的產品是符合其要求的。
二者的不同之處在于：
一、內容不同：
OCS僅僅是產品的生產管理。
GOTS確包含三方面；產品生產管理，環境保護，社會責任。
二、證對象不同：
OCS認證的對象是用認可的有機原料生產度的使用非食品產品。
GOTS認證僅限于用有機天然纖維生產的紡織品。
